هرچند که رئیس سازمان سنجش آموزش کشور تأکید کرده است که با دانشگاه‌هایی که از داوطلبان دوره دکتری تعهد قبل از موعد مقرر می‌گیرند برخورد می‌شود و حق چنین کاری را ندارند اما همچنان داوطلبان این آزمون نسبت به عملکرد دانشگاه‌ها گلایه دارند.